Жребий свел на этой стадии турнира следующих соперников:

Калев (Силламяэ) - Калью
Флора - Сантос (Тарту)
Таммека (Тарту) - Тырва
Виймси - Форца (Таллинн)

Четвертьфинальные матчи состоятся в апреле. Обладатель Кубка Эстонии определится 21 мая.